Ya sí funciona el kernel 4.10.0 con la creación de los paquetes.

La solución es sencillísima:

https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=849357#25

Ya tengo el paquete linux-headers en este momento...¡SOLVENTADO!

Nada más verlo de arriba como mi mensaje, lo he solucionado cambiando unas líneas que están en

/usr/share/kernel-package/ruleset/targets/headers.mk

¡Costó!...